Lo strumento prediletto da Pastorius era il basso elettrico fretless - inventato non da Pastorius come molti credono (infatti veniva usato già negli anni sessanta da John Entwistle dei The Who, Bill Wyman dei Rolling Stones, e anche da John Paul Jones dei Led Zeppelin), bensì da Leo Fender che in un'intervista si vantava di essere stato il primo a mettere la barrette di precisione (i tasti) sul basso elettrico (da qui il nome di Precision Bass) e quindi anche il primo a levarle.

Secondo il suo biografo Bill Milkowsky, però, Jaco fu il primo, comprando nel 1967 un Fender Jazz Bass '62 e togliendo i tasti dalla tastiera, riempiendo poi i solchi con mastice per legno e rivestendo il manico con dieci strati di una resina epossidica marina chiamata "Petitt's Poly-Poxy".

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