Il costo della spedizione che fai pagare all'acquirente lo devi mettere nella ricevuta fiscale, appunto perchè poi tu lo detrai negli acquisti.

In teoria la ricevuta fiscale non è obbligatoria, basta il registro corrispettivi.
Lascia perdere il registratore di cassa, che è costoso e richiede una manutenzione obbligatoria, pure costosa.

Fai una ricevuta fiscale unica, con due voci, uno per l'oggetto e uno per la spedizione, un totale.
Se un acquirente prende due o più oggetti, non devi fargli diverse ricevute, una sola con tutte le voci.