Vendere su eBay non è commercio elettronico, ma commercio "improprio" o indiretto.
Quindi in teoria come dice eBay non è obbligatorio comunicare al comune se hai già un negozio al pubblico.
Io l'ho fatto quando avevo il negozio fisico, e all'ufficio commercio non sapevano quasi la procedura da seguire, visto che a loro detta ero l'unica, e non era un paesino.

Se non ti registri su eBay come professionale e non inserisci la partita IVA, non puoi detrarre la fattura delle tariffe pagate. Che senso ha per un commerciante??

Forse quelli che vendono come privati e dichiarano di inviare scontrino o fattura vendono non cose loro, ma cose di amici o parenti che hanno un negozio.