Non mi e' chiara una cosa, ovvero il perche' il venditore professionale puoi chiedere che le tariffe di ebay vengano fatturate fuori campo IVA, dato che ho letto in un tuo post di leo-one che:
i venditori con account professionale NON SONO ESENTI da IVA.
Sono le FATTURE DI EBAY emesse verso account professionali che sono IN ESENZIONE D'IVA.
Le fatture in esenzione di Iva vanno poi portate in contabilità attraverso lo strumento dell'autofatturazione e quindi si paga l'IVA!

Ma non si puo' senza fare la richiesta, portare direttamente la fattura dal commercialista (ovvero con l'aliquota del 20%) e farla registrare?